农业部下属:格林比特岛农业研究院,No.0001号卡巴内世界。
建设部下属:工程院,建工司,设计司。
宗教部下属:佛教司,基督教司。
卫生部下属:磁鼓岛医学院,所有世界医院,防疫司。
【全军最高指挥院】
下属统帅部,军政部,参谋部。
统帅部下属:陆军本部,海军本部,空军本部,海忍村,辅助军团。
军政部下属:陆军军政司,海军军政司,空军军政司,战争军事学院,三军本部军校,忍界五大综合忍者高等学院,五大专科忍者高等学院。
参谋部下属:参谋一司,参谋二司,参谋三司,战功统计司。
【审判院】
下属司法岛,最高法院,司法部,警政部。
最高法院下属:法巡庭,法官庭,法才庭。
司法部下属:监狱管理署,改造司,推进城海底监狱,巴尔迪哥白土监狱,以及其他中小型监狱。
警政部下属:公安司,宪警局,赏金研究署。
【宣政院】
下属宣传部,科学院,铁道部,外务部,历史研究部,万界百强战力大赛主办部。