宣传部下属：新闻署，传媒署，版权署，荣誉司，漫画司。

科学院下属：生化研究院，材料研究院，船舶研究院，炼金研究院，武器研究院，能源研究院，机械研究院，潜艇研究院，航空研究院，气象研究院，空间研究院。

铁道部下属：列车司，红土大陆甲铁城铁路系统。

外务部下属：加盟国事务司，非加盟国审核司。

历史研究部下属：学园都市奥哈拉大图书馆，历史正文处理司。

【CIPHER POL总部】

下属CIPHER POL-AIGIS 0，CIPHER POL No.9- CIPHER POLNo1，冠昊岛。

【阎罗院】

下属黄泉城，判官部，轮回部，冥军总部，灵子研究院。

黄泉城下属：海星冥界，卡巴内冥界，鬼灭冥界，巨人冥界，帝具冥界，零魔冥界。

判官部下属：冥律司，冥判司，冥城司，冥使司，冥币司，冥泉司，冥录司。

轮回部下属：天道司，人道司，鬼道司，地狱道司，畜生道司，阿修罗道司。

地狱道司下属：红莲地狱，猛鬼地狱，冥水地狱，赤犬地狱，青雉地狱，沙鳄地狱。

【半官方组织】

御刀斋，名刀镇，阴阳寮，魔法师协会，冒险者协会，厨师协会。